Kasus infeksi menular seksual bakteri sedang meningkat di seluruh dunia. Sebuah tim internasional yang dipimpin oleh University of Zurich kini telah mengembangkan metode baru untuk sekuensing genom dan menemukan strain Chlamydia yang sebelumnya tidak diakui
Menurut Organisasi Kesehatan Dunia (WHO), ratusan juta kasus baru infeksi menular seksual bakteri (IMS) dilaporkan di seluruh dunia setiap tahun. Banyak infeksi tidak terdiagnosis karena gejala mereka yang sering diam, berkontribusi terhadap penularan, penyakit dan komplikasi seperti infertilitas dan keguguran. Menangani tantangan IMS global bakteri yang menyebabkan klamidia, gonore, sifilis dan juga genitalium mycoplasma tetap menjadi masalah kesehatan masyarakat yang signifikan. Dengan meningkatnya tingkat infeksi dan meningkatnya resistensi antimikroba, memahami patogen ini sangat penting untuk meningkatkan diagnosis, pengobatan dan strategi pencegahan.
Mempelajari bakteri di belakang IMS sangat sulit. Banyak dari patogen ini tidak dapat ditanam di laboratorium, dan sampel klinis mengandung banyak DNA manusia, menjadikan sekuensing genom bakteri IST menjadi tugas yang menakutkan. Namun, genom berisi informasi genetik bakteri ini, termasuk seberapa terkait mereka satu sama lain, dan seberapa resistennya mereka dengan antibiotik.
Sebuah tim ilmuwan yang dipimpin oleh Helena Seth-Smith dari University of Zurich (UZH), Swiss, dengan kolaborasi internasional ke University of Buenos Aires, Argentina, telah mengembangkan teknologi target “pengayaan pengayaan” yang mutakhir. Menggunakan probe molekuler yang dirancang khusus, mereka “memancing” untuk bakteri IMS DNA dari sampel klinis, memungkinkan analisis genom resolusi tinggi. “Metode ini membantu kita memahami bagaimana Chlamydia menyebar dan beradaptasi,” kata Helena Seth-Smith, co-head genomik mikroba dan kepala bioinformatika di Institute of Medical Microbiology.
Tim menemukan garis keturunan Chlamydia trachomatis yang sebelumnya tidak diketahui di Argentina. Strain baru ini “ompa-genotipe L4”, yang memiliki karakteristik genetik yang berbeda dari tiga strain yang diketahui, ditemukan dalam sampel dubur dari pria, yang berhubungan seks dengan pria. Chlamydia terutama ditularkan melalui selaput lendir selama seks tanpa kondom. Para pasien dengan garis keturunan L4 biasanya menunjukkan gejala seperti peradangan dubur, buang air besar yang sulit atau mendesak dan keluarnya dubur.
“Temuan kami membuka perbatasan baru dalam memahami IMS dan menekankan sifat dinamis dari jalur transmisi dan pengembangan STI,” kata Karina Büttner dari Uzh. “Dengan alat -alat ini, kami dapat mendukung upaya kesehatan masyarakat dengan lebih baik untuk mengendalikan dan mencegah infeksi ini.”
Kerjasama global dalam melacak infeksi ini sangat penting. Penyakit menular seksual sering memengaruhi kelompok populasi dengan sedikit atau tanpa akses ke perawatan kesehatan atau pendidikan. Menurut para peneliti, metode baru dan pemahaman yang lebih baik tentang susunan genetik patogen akan memungkinkan untuk mengidentifikasi tren resistensi antibiotik, meningkatkan tes diagnostik dan menyesuaikan perawatan terhadap ancaman yang tumbuh yang ditimbulkan oleh IMS.
Literatur
Karina Andrea Büttner et al. Genom Chlamydia trachomatis dari sampel dubur: Deskripsi clade baru yang terdiri dari ompa-genotipe L4 dari Argentina. Genomik Mikroba, 13 Februari 2025. DOI 10.1099/MGEN.0.001350
Karina Andrea Büttner et al. Evaluasi metode untuk pengurutan genom Chlamydia trachomatis dan bakteri menular seksual lainnya langsung dari swab klinis. Genomik mikroba, tanggal. Doi: 10.1099/mgen.0.001353
